成本问题

造成冷链断裂的主要原因还是成本问题。据了解，如果使用全程冷链物流体系，冷冻食品生产企业物流成本将达到产品销售额的50－70，而采取土法保温或常温运输方式，东莞冷链物流成本可能只有20.目前，我国冷冻食品市场和东莞冷链物流市场还处于低价竞争的阶段，中国制冷协会副秘书长杨一凡认为如果采用严格的冷链运输标准将增加供应链成本2倍以上，这将使许多冷冻食品生产企业散失竞争力。

诚信问题

一方面是东莞冷链物流企业的诚信问题，由于冷冻食品生产企业的压价以及冷链经营成本的不断攀升，冷链物流企业为了生存，不惜不顾信誉，在运输、配送、装卸搬运等过程中断链条。另一方面是零售商的诚信问题，在冷链物流企业与商超对接中，冷链物流企业虽然保证全程按达标温度冷藏运输，但有时由于超市收货效率低下，东莞冷链物流冷冻食品因为等待时间过长，导致温度超过允许，超市往往把责任归于冷链物流企业。

知识和观念问题

受我国经济发展水平的制约，东莞冷链物流在我国还是个新生儿，不管是社会还是民众对冷链都缺乏足够的认识。不管是冷冻食品生产企业、冷链物流企业，还是商超都普遍认为，冷链即使有时有点纰漏也不是很大的问题，最多只是产品质量问题，又不会吃死人。很多民众只看到冷冻食品表面的光鲜，却不关注冷冻食品从生产商到消费者手中是否都有严格的温度控制，否则，即使表面再光鲜，那也是“金玉其外，败絮其中”。